La 'Nativité mystique' montre des anges et des hommes célébrant la naissance de Jésus-Christ. La Vierge Marie s'agenouille en adoration devant son fils, surveillée par le bœuf et l'âne à la crèche. Le mari de Marie, Joseph , dort à proximité. Les bergers et les sages sont venus visiter le roi nouveau-né. Les anges dans les cieux dansent et chantent des hymnes de louange. Sur terre, ils proclament la paix, embrassant joyeusement des hommes vertueux tandis que sept démons fuient vaincus dans le monde souterrain. 

La photo de Botticelli a longtemps été appelée la «Nativité mystique» en raison de son symbolisme mystérieux. Il combine la naissance du Christ comme le dit le Nouveau Testament avec une vision de sa seconde venue comme promis dans le livre de l'Apocalypse. La seconde venue - le retour du Christ sur terre - annoncerait la fin du monde et la réconciliation des chrétiens pieux avec Dieu. 

L'image a été peinte un millénaire et demi après la naissance du Christ, lorsque les bouleversements religieux et politiques ont déclenché des avertissements prophétiques sur la fin du monde. 

'La Nativité Mystique' a probablement été peint comme une œuvre de dévotion privée pour un patron florentin.